1) Présentation générale
Une chaine de prétraitements typique comprends les étapes suivantes :
- Supprimer les premiers volumes de chaque série (Il suffit de supprimer à la main le nombre de volumes désirés.Pour les utilisateurs de Brainwave, ce dernier peut s'occuper de supprimer les premières images.)
- Changer la position de l'origine (Purement optionnel, peut être une source d'erreur)
- Corriger le décalage d'acquisition entre les coupes fonctionnelles ("Slice Timing")
- Corriger le mouvement dans les séries fonctionnelles
- Réorienter les images si nécessaire
- Normaliser les images anatomiques et/ou fontcionnelles dans un repère commun.
- Lisser spatialement les images fonctionnelles.
L'ordre dans lequel enchainer ces étapes dépend de l'ordre dans lequel sont acquises les coupes d'un volume fonctionnel, c'est à dire en mode entrelacé ou séquentiel.
->Etapes à suivre en mode séquentiel. (cliquer)
->Etapes à suivre en mode entrelacé.(cliquer)
D'autres étapes de prétraitement spatial peuvent être utilisées suivant les besoins :
- Le recalage inter-modalités ("Coregister")
- La segmentation des images en images de matière blanche, matière grise et liquide céphalo-rachidien.
- Le rendu 3D